La Morfología microscópica es una herramienta fundamental para la identificación de los hongos, particularmente en los de tipo filamentoso. La Morfología es esencialmente un arte comparativo, es aprendido iconográficamente cuando las imágenes se comparan, teniendo la premisa: Sólo lo vemos cuando lo conocemos.
Al exámen microscópico a fresco, en la raíz del pelo pueden observarse la posición de las artroconidias en relación con la estructura capilar. Las artroconidias pueden encontrarse fuera del hilo del pelo y dispuestas en cadena, o en mosaico (patrón ectotrix), o intrapilarmente, ocupando la médula del pelo (patrón endotrix). Las uñas presentan las mayores dificultades para estudiar, ya que los elementos fúngicos frecuentemente están en cantidades pequeñas.
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